El artículo 79 de la Ley Orgánica del Poder Judicial, establece que el Consejo Superior podrá integrar comisiones de trabajo, en asuntos de su competencia. A la fecha, los integrantes del Consejo Superior conforman las siguientes comisiones:
Comisiones en que participa el Lic. Gary Bonilla Garro
- Comisión Selección y Eliminación de Documentos.
- Comisión de Buenas Prácticas de Gestión Judicial.
- Comisión de Violencia Doméstica.
- Política Integral de Bienestar y Salud Laboral.
- Comisión RAC.
- Comisión de Justicia Abierta (se unifico con la Comisión Interinstitucional de Facilitadores CONAMAJ)
- Comisión de Datos Abiertos.
- Suplente Consejo de la Judicatura.
- Comisión de la Jurisdicción Penal.
- Comisión de Implementación de la Ley Marco de Empleo Público.
Comisiones en las que participa la Máster. Siria Carmona Castro
- Comisión Interinstitucional de Tránsito.
- Tribunal de Reconocimientos.
- Integrante del Consejo de la Judicatura.
- Suplente del Comité Técnico de Continuidad del Servicio del Poder Judicial (CTCSTJ).
Comisiones en las que participa la Máster. Ana Isabel Orozco Álvarez
- Comisión de Teletrabajo.
- Comisión de Incapacidades.
- Comisión de Construcciones.
- Comité Gerencial de Tecnología de la Información.
- Comisión de Transparencia.
- Comisión de Ética y Valores.
- Comisión de Emergencias
- Comité de Planeación Estratégica
Comisiones en las que participa la Licda. Sandra Pizarro Gutiérrez
- Comisión de Personas Usuarias.
- Comisión de Buenas Prácticas de Gestión Judicial.
- Programa Hacia Cero Papel.
- Comisión de Justicia Abierta.
- Comisión Gica - Justicia.
- Comisión de Gestión Ambiental.
- Subcomisión para el acceso a la Justicia de la Niñez y Adolescencia.
- Subcomisión de Acceso a la Justicia de Pueblos Indígenas.
- Comisión de Protección de Datos.
- Comisión de Mixta que Analizará la Mora Judicial.
- Comisión Jurisdicción Especializada en Delincuencia Organizada (JEDO).
- Coordinación del área de Control Interno.
- Coordinadora del Protocolo de actuación para la contratación de peritajes externos.
- Comité Técnico de Continuidad del Servicio del Poder Judicial (CTCSTJ).